MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	CT	3	6	1269	1274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008383	GAA	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008383	CT	3	6	2350	2355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008383	AGA	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008383	AG	3	6	6678	6683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008383	CT	3	6	8422	8427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008383	CAT	2	6	8434	8439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008383	ACA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008383	A	6	6	8525	8530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008383	ACA	2	6	8541	8546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008383	AATC	2	8	11959	11966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008383	GGT	2	6	11991	11996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008383	ATA	2	6	12034	12039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008383	ATA	2	6	12073	12078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008383	GCC	2	6	13238	13243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008383	ACG	2	6	13248	13253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008383	GGC	2	6	13596	13601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008383	TAT	2	6	13904	13909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008383	CAC	2	6	17372	17377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008383	TCA	2	6	17406	17411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008383	CA	3	6	17452	17457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008383	TTTGAC	2	12	17555	17566	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008383	TAC	2	6	17586	17591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008383	GAG	2	6	17628	17633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008383	AGCG	2	8	18184	18191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008383	AC	3	6	18193	18198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008383	TCG	2	6	19274	19279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008383	AAGCC	2	10	19343	19352	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008383	ACG	2	6	19481	19486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008383	ACC	2	6	19502	19507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008383	GAA	2	6	19599	19604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008383	CAT	2	6	20307	20312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008383	ATT	2	6	20325	20330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008383	CAG	2	6	20710	20715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008383	CGC	2	6	20739	20744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008383	CGAT	2	8	20768	20775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008383	GC	4	8	20898	20905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008383	GCC	2	6	21056	21061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008383	AGG	3	9	21074	21082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008383	CCG	2	6	21419	21424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008383	GCC	2	6	21470	21475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008383	AG	4	8	21618	21625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008383	CGA	2	6	22162	22167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008383	AGG	3	9	24004	24012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008383	GGA	2	6	26884	26889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008383	TCCT	2	8	31544	31551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008383	CAT	2	6	34406	34411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008383	CGG	2	6	34443	34448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008383	ATG	2	6	34456	34461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008383	ATG	2	6	34564	34569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008383	TCC	2	6	35272	35277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008383	CTG	2	6	36342	36347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008383	ACCAA	2	10	36565	36574	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008383	CTC	2	6	36851	36856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008383	CCGA	2	8	36857	36864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008383	CCG	2	6	36874	36879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008383	A	7	7	36898	36904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008383	TGGA	2	8	36971	36978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008383	GGC	2	6	36993	36998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008383	GGA	2	6	37004	37009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008383	AAT	2	6	37025	37030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008383	ATTT	2	8	37043	37050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008383	GCT	2	6	37059	37064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008383	CGC	2	6	37123	37128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008383	GATC	2	8	37147	37154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008383	TTTA	2	8	37924	37931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008383	AGG	2	6	37946	37951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008383	GCC	2	6	39719	39724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008383	ACC	2	6	39754	39759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008383	TTG	2	6	39782	39787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008383	ATAA	2	8	39831	39838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008383	GCC	2	6	39898	39903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008383	AG	3	6	39918	39923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008383	CGA	2	6	39931	39936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008383	GGA	2	6	39946	39951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008383	TGG	2	6	41006	41011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008383	GGC	2	6	41053	41058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008383	CGA	2	6	41092	41097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008383	AGCG	2	8	41279	41286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008383	TGG	2	6	41305	41310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008383	ACC	2	6	41397	41402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008383	AGC	2	6	41543	41548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008383	TCGA	2	8	41582	41589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008383	ACCG	2	8	41639	41646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008383	TCCA	2	8	41657	41664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008383	ACG	2	6	41751	41756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008383	GCG	2	6	41764	41769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008383	GCC	2	6	41802	41807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008383	GATC	2	8	41824	41831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008383	CATG	2	8	41875	41882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008383	G	6	6	42062	42067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008383	GAC	2	6	42144	42149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008383	GGA	2	6	42331	42336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008383	GC	3	6	42380	42385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008383	TGA	2	6	42390	42395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008383	GCC	2	6	42410	42415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008383	GCC	2	6	42460	42465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008383	GAC	2	6	42552	42557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008383	GCC	2	6	42596	42601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008383	GAT	2	6	42617	42622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008383	CAG	2	6	42713	42718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008383	GCATCG	2	12	42783	42794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008383	GTT	2	6	42846	42851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008383	ATCG	2	8	42858	42865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008383	CATG	2	8	43928	43935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008383	AGC	2	6	43956	43961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008383	CAA	2	6	45376	45381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008383	CGG	2	6	45393	45398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008383	GC	3	6	45420	45425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008383	GAG	3	9	45446	45454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008383	AGG	2	6	45455	45460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008383	GGA	3	9	47046	47054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008383	GGC	2	6	48504	48509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008383	GCCG	2	8	48529	48536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008383	ACCG	2	8	48550	48557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008383	TCAA	2	8	48633	48640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008383	GAC	2	6	50597	50602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008383	TGC	2	6	50619	50624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008383	TA	3	6	52417	52422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008383	GCG	2	6	55289	55294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008383	GCG	2	6	55304	55309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008383	GTT	2	6	55423	55428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008383	CGA	2	6	55446	55451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008383	CG	3	6	55465	55470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008383	CG	3	6	55503	55508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008383	GAC	2	6	55569	55574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008383	TGGC	2	8	55621	55628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008383	CAA	2	6	55662	55667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008383	CGA	2	6	55680	55685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008383	CGC	2	6	55692	55697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008383	GTG	2	6	55722	55727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008383	CTG	2	6	55747	55752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008383	CCT	2	6	55762	55767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008383	GCC	2	6	55768	55773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008383	CAAG	2	8	55780	55787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008383	CGG	2	6	55788	55793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008383	CGA	2	6	55947	55952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008383	TGG	2	6	56071	56076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008383	CAT	2	6	56186	56191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008383	GCC	2	6	56246	56251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008383	TC	4	8	56354	56361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008383	CCG	2	6	56364	56369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008383	GGC	2	6	56377	56382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008383	GGC	2	6	56386	56391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008383	GCCG	2	8	56416	56423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008383	TGC	2	6	56502	56507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_008383	TGT	2	6	56734	56739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008383	CGG	2	6	56752	56757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008383	GGC	2	6	56764	56769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008383	GGT	2	6	56770	56775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_008383	CGA	2	6	57292	57297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_008383	GGC	2	6	59381	59386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_008383	GCC	2	6	59977	59982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_008383	C	6	6	59999	60004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
183	NC_008383	GAC	3	9	60005	60013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_008383	GGA	2	6	92345	92350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_008383	GAC	2	6	120060	120065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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413	NC_008383	CGC	2	6	120243	120248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_008383	GTT	2	6	120256	120261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_008383	T	6	6	120751	120756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_008383	GGGA	3	12	120767	120778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
418	NC_008383	CCG	2	6	121361	121366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_008383	GCGCC	2	10	122234	122243	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
421	NC_008383	ATC	2	6	122278	122283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_008383	CGT	2	6	122309	122314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_008383	CGG	2	6	123752	123757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_008383	TCC	2	6	123844	123849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_008383	CCG	2	6	126403	126408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_008383	GACGC	2	10	126449	126458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
427	NC_008383	CTG	2	6	126460	126465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_008383	GCC	2	6	126481	126486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_008383	AACG	2	8	126494	126501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
430	NC_008383	CGT	3	9	133145	133153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_008383	CG	3	6	133154	133159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
432	NC_008383	GGC	2	6	133239	133244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_008383	TGTC	2	8	133292	133299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
434	NC_008383	CCT	2	6	133311	133316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_008383	CTT	2	6	133324	133329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_008383	TTA	2	6	133335	133340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_008383	G	6	6	133368	133373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
438	NC_008383	TTCC	2	8	135989	135996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_008383	GGT	2	6	136017	136022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
440	NC_008383	AAT	2	6	136026	136031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_008383	TTTCG	3	15	136066	136080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
442	NC_008383	AGTG	2	8	136162	136169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_008383	CCG	2	6	136213	136218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_008383	CG	3	6	136217	136222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
445	NC_008383	AGA	2	6	136305	136310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_008383	GCA	2	6	136311	136316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_008383	GCA	2	6	137472	137477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_008383	T	7	7	137480	137486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_008383	TG	3	6	140816	140821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
450	NC_008383	CGG	2	6	142047	142052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_008383	GCG	2	6	142112	142117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_008383	CGG	2	6	142118	142123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_008383	ACG	2	6	142174	142179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_008383	AGG	2	6	147124	147129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_008383	AGAC	2	8	147130	147137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_008383	CG	3	6	147147	147152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
457	NC_008383	GGT	2	6	147216	147221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
458	NC_008383	GT	3	6	147445	147450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.